Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc39Q9D5Y1 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc39Q9D5Y1 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc39Q9D5Y1 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc39Q9D5Y1 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc39Q9D5Y1 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc39Q9D5Y1 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc39Q9D5Y1 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc39Q9D5Y1 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc39Q9D5Y1 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc39Q9D5Y1 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc39Q9D5Y1 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc39Q9D5Y1 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc39Q9D5Y1 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc39Q9D5Y1 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc39Q9D5Y1 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc39Q9D5Y1 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc39Q9D5Y1 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc39Q9D5Y1 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc39Q9D5Y1 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms