Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U4

H2al3, H2A histone family member L3, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al3Q9D4U4 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
H2al3Q9D4U4 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms