Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4K7

Ccdc105, Coiled-coil domain-containing protein 105, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc105Q9D4K7 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc105Q9D4K7 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms