Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Lonrf3Q9D4H7 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms