Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms