Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H5

Trim42, Tripartite motif-containing protein 42, mousemouse

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Length 723 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim42Q9D2H5 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim42Q9D2H5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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