Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2C9

Snapc3, snRNA-activating protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc3Q9D2C9 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Snapc3Q9D2C9 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms