Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1T0

Lingo1, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lingo1Q9D1T0 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lingo1Q9D1T0 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms