Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9D1F3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9D1F3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9D1F3 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9D1F3 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9D1F3 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9D1F3 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9D1F3 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9D1F3 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Q9D1F3 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Q9D1F3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Q9D1F3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms