Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hddc3Q9D114 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hddc3Q9D114 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms