Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Zbed3Q9D0L1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbed3Q9D0L1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbed3Q9D0L1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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