Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZX0

Elp3, Elongator complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elp3Q9CZX0 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Elp3Q9CZX0 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms