Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT8

Pmpcb, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmpcbQ9CXT8 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.05■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PmpcbQ9CXT8 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PmpcbQ9CXT8 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms