Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Exo5Q9CXP9 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Exo5Q9CXP9 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Exo5Q9CXP9 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Exo5Q9CXP9 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Exo5Q9CXP9 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Exo5Q9CXP9 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Exo5Q9CXP9 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Exo5Q9CXP9 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Exo5Q9CXP9 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Exo5Q9CXP9 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Exo5Q9CXP9 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Exo5Q9CXP9 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Exo5Q9CXP9 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Exo5Q9CXP9 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Exo5Q9CXP9 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Exo5Q9CXP9 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Exo5Q9CXP9 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Exo5Q9CXP9 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Exo5Q9CXP9 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Exo5Q9CXP9 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Exo5Q9CXP9 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
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Exo5Q9CXP9 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Exo5Q9CXP9 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Exo5Q9CXP9 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Exo5Q9CXP9 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Exo5Q9CXP9 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Exo5Q9CXP9 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Exo5Q9CXP9 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
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Exo5Q9CXP9 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Exo5Q9CXP9 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Exo5Q9CXP9 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Exo5Q9CXP9 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Exo5Q9CXP9 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Exo5Q9CXP9 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Exo5Q9CXP9 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Exo5Q9CXP9 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Exo5Q9CXP9 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Exo5Q9CXP9 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Exo5Q9CXP9 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Exo5Q9CXP9 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Exo5Q9CXP9 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Exo5Q9CXP9 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Exo5Q9CXP9 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Exo5Q9CXP9 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Exo5Q9CXP9 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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