Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nip7Q9CXK8 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nip7Q9CXK8 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nip7Q9CXK8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nip7Q9CXK8 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nip7Q9CXK8 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nip7Q9CXK8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nip7Q9CXK8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nip7Q9CXK8 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nip7Q9CXK8 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nip7Q9CXK8 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nip7Q9CXK8 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nip7Q9CXK8 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nip7Q9CXK8 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nip7Q9CXK8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nip7Q9CXK8 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nip7Q9CXK8 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nip7Q9CXK8 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nip7Q9CXK8 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nip7Q9CXK8 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nip7Q9CXK8 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nip7Q9CXK8 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nip7Q9CXK8 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nip7Q9CXK8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nip7Q9CXK8 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nip7Q9CXK8 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nip7Q9CXK8 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nip7Q9CXK8 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nip7Q9CXK8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nip7Q9CXK8 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nip7Q9CXK8 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nip7Q9CXK8 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nip7Q9CXK8 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nip7Q9CXK8 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nip7Q9CXK8 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nip7Q9CXK8 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nip7Q9CXK8 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nip7Q9CXK8 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nip7Q9CXK8 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nip7Q9CXK8 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nip7Q9CXK8 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nip7Q9CXK8 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nip7Q9CXK8 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nip7Q9CXK8 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nip7Q9CXK8 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nip7Q9CXK8 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nip7Q9CXK8 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nip7Q9CXK8 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nip7Q9CXK8 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nip7Q9CXK8 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nip7Q9CXK8 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nip7Q9CXK8 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nip7Q9CXK8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nip7Q9CXK8 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nip7Q9CXK8 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nip7Q9CXK8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nip7Q9CXK8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nip7Q9CXK8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nip7Q9CXK8 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nip7Q9CXK8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nip7Q9CXK8 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nip7Q9CXK8 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nip7Q9CXK8 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nip7Q9CXK8 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nip7Q9CXK8 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nip7Q9CXK8 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nip7Q9CXK8 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nip7Q9CXK8 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nip7Q9CXK8 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nip7Q9CXK8 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nip7Q9CXK8 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nip7Q9CXK8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Nip7Q9CXK8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nip7Q9CXK8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nip7Q9CXK8 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nip7Q9CXK8 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Nip7Q9CXK8 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nip7Q9CXK8 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nip7Q9CXK8 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Nip7Q9CXK8 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nip7Q9CXK8 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nip7Q9CXK8 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nip7Q9CXK8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nip7Q9CXK8 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nip7Q9CXK8 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nip7Q9CXK8 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nip7Q9CXK8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nip7Q9CXK8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nip7Q9CXK8 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nip7Q9CXK8 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nip7Q9CXK8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nip7Q9CXK8 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nip7Q9CXK8 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nip7Q9CXK8 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nip7Q9CXK8 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nip7Q9CXK8 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nip7Q9CXK8 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nip7Q9CXK8 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nip7Q9CXK8 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nip7Q9CXK8 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms