Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmed5Q9CXE7 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmed5Q9CXE7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmed5Q9CXE7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmed5Q9CXE7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmed5Q9CXE7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmed5Q9CXE7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmed5Q9CXE7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmed5Q9CXE7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmed5Q9CXE7 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmed5Q9CXE7 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmed5Q9CXE7 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmed5Q9CXE7 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmed5Q9CXE7 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmed5Q9CXE7 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmed5Q9CXE7 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmed5Q9CXE7 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmed5Q9CXE7 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmed5Q9CXE7 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmed5Q9CXE7 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmed5Q9CXE7 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmed5Q9CXE7 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmed5Q9CXE7 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmed5Q9CXE7 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmed5Q9CXE7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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