Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RpainQ9CWY9 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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RpainQ9CWY9 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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RpainQ9CWY9 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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RpainQ9CWY9 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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RpainQ9CWY9 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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RpainQ9CWY9 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms