Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
NubplQ9CWD8 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms