Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pard3bQ9CSB4 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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