Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Atg12Q9CQY1 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms