Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim8Q9CQQ0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms