Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC9

Sar1b, GTP-binding protein SAR1b, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1bQ9CQC9 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sar1bQ9CQC9 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sar1bQ9CQC9 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms