Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nsmce3Q9CPR8 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nsmce3Q9CPR8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nsmce3Q9CPR8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nsmce3Q9CPR8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nsmce3Q9CPR8 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nsmce3Q9CPR8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nsmce3Q9CPR8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nsmce3Q9CPR8 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nsmce3Q9CPR8 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nsmce3Q9CPR8 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nsmce3Q9CPR8 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nsmce3Q9CPR8 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nsmce3Q9CPR8 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nsmce3Q9CPR8 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms