Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smim3Q99PE5 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smim3Q99PE5 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smim3Q99PE5 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim3Q99PE5 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim3Q99PE5 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim3Q99PE5 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim3Q99PE5 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim3Q99PE5 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim3Q99PE5 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim3Q99PE5 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim3Q99PE5 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim3Q99PE5 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim3Q99PE5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim3Q99PE5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim3Q99PE5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim3Q99PE5 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim3Q99PE5 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim3Q99PE5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim3Q99PE5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim3Q99PE5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim3Q99PE5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim3Q99PE5 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim3Q99PE5 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim3Q99PE5 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim3Q99PE5 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim3Q99PE5 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim3Q99PE5 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim3Q99PE5 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim3Q99PE5 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim3Q99PE5 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim3Q99PE5 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim3Q99PE5 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim3Q99PE5 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim3Q99PE5 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim3Q99PE5 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim3Q99PE5 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Smim3Q99PE5 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim3Q99PE5 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms