Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nup155Q99P88 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nup155Q99P88 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nup155Q99P88 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nup155Q99P88 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nup155Q99P88 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nup155Q99P88 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nup155Q99P88 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nup155Q99P88 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Nup155Q99P88 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nup155Q99P88 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nup155Q99P88 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Nup155Q99P88 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nup155Q99P88 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nup155Q99P88 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nup155Q99P88 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nup155Q99P88 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nup155Q99P88 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nup155Q99P88 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nup155Q99P88 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nup155Q99P88 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nup155Q99P88 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nup155Q99P88 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nup155Q99P88 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nup155Q99P88 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nup155Q99P88 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nup155Q99P88 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nup155Q99P88 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nup155Q99P88 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nup155Q99P88 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Nup155Q99P88 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Nup155Q99P88 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nup155Q99P88 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Nup155Q99P88 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Nup155Q99P88 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Nup155Q99P88 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nup155Q99P88 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Nup155Q99P88 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nup155Q99P88 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nup155Q99P88 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nup155Q99P88 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nup155Q99P88 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nup155Q99P88 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nup155Q99P88 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nup155Q99P88 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nup155Q99P88 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nup155Q99P88 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nup155Q99P88 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nup155Q99P88 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nup155Q99P88 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nup155Q99P88 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nup155Q99P88 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nup155Q99P88 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nup155Q99P88 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nup155Q99P88 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nup155Q99P88 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nup155Q99P88 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nup155Q99P88 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nup155Q99P88 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nup155Q99P88 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nup155Q99P88 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nup155Q99P88 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nup155Q99P88 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nup155Q99P88 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nup155Q99P88 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nup155Q99P88 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nup155Q99P88 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nup155Q99P88 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Nup155Q99P88 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Nup155Q99P88 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nup155Q99P88 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nup155Q99P88 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Nup155Q99P88 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Nup155Q99P88 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nup155Q99P88 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nup155Q99P88 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nup155Q99P88 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nup155Q99P88 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nup155Q99P88 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nup155Q99P88 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nup155Q99P88 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nup155Q99P88 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nup155Q99P88 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nup155Q99P88 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nup155Q99P88 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nup155Q99P88 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nup155Q99P88 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nup155Q99P88 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nup155Q99P88 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Nup155Q99P88 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nup155Q99P88 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nup155Q99P88 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nup155Q99P88 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nup155Q99P88 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nup155Q99P88 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nup155Q99P88 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nup155Q99P88 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nup155Q99P88 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nup155Q99P88 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nup155Q99P88 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms