Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NsmfQ99NF2 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms