Protein–RNA interactions for Protein: Q99MW3

Pramel1, Preferentially expressed antigen in melanoma-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel1Q99MW3 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pramel1Q99MW3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms