Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tdrd1Q99MV1 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms