Protein–RNA interactions for Protein: Q99MQ3

Pink1, Serine/threonine-protein kinase PINK1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pink1Q99MQ3 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pink1Q99MQ3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pink1Q99MQ3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pink1Q99MQ3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pink1Q99MQ3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pink1Q99MQ3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pink1Q99MQ3 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pink1Q99MQ3 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pink1Q99MQ3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pink1Q99MQ3 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pink1Q99MQ3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pink1Q99MQ3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pink1Q99MQ3 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pink1Q99MQ3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pink1Q99MQ3 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pink1Q99MQ3 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pink1Q99MQ3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pink1Q99MQ3 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pink1Q99MQ3 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pink1Q99MQ3 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pink1Q99MQ3 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pink1Q99MQ3 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pink1Q99MQ3 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pink1Q99MQ3 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pink1Q99MQ3 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pink1Q99MQ3 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pink1Q99MQ3 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pink1Q99MQ3 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pink1Q99MQ3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pink1Q99MQ3 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pink1Q99MQ3 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pink1Q99MQ3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pink1Q99MQ3 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pink1Q99MQ3 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pink1Q99MQ3 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pink1Q99MQ3 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pink1Q99MQ3 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pink1Q99MQ3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pink1Q99MQ3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pink1Q99MQ3 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pink1Q99MQ3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pink1Q99MQ3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pink1Q99MQ3 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pink1Q99MQ3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pink1Q99MQ3 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pink1Q99MQ3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pink1Q99MQ3 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pink1Q99MQ3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pink1Q99MQ3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pink1Q99MQ3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pink1Q99MQ3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pink1Q99MQ3 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pink1Q99MQ3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pink1Q99MQ3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pink1Q99MQ3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pink1Q99MQ3 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pink1Q99MQ3 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pink1Q99MQ3 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pink1Q99MQ3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pink1Q99MQ3 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pink1Q99MQ3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pink1Q99MQ3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pink1Q99MQ3 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pink1Q99MQ3 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pink1Q99MQ3 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pink1Q99MQ3 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pink1Q99MQ3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pink1Q99MQ3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pink1Q99MQ3 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pink1Q99MQ3 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pink1Q99MQ3 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pink1Q99MQ3 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pink1Q99MQ3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pink1Q99MQ3 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pink1Q99MQ3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pink1Q99MQ3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pink1Q99MQ3 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pink1Q99MQ3 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pink1Q99MQ3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pink1Q99MQ3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pink1Q99MQ3 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pink1Q99MQ3 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pink1Q99MQ3 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pink1Q99MQ3 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pink1Q99MQ3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pink1Q99MQ3 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pink1Q99MQ3 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pink1Q99MQ3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pink1Q99MQ3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pink1Q99MQ3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pink1Q99MQ3 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pink1Q99MQ3 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pink1Q99MQ3 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pink1Q99MQ3 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pink1Q99MQ3 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pink1Q99MQ3 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pink1Q99MQ3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pink1Q99MQ3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pink1Q99MQ3 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pink1Q99MQ3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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