Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp1b4Q99ME6 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms