Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB3

Tm2d1, TM2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d1Q99MB3 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tm2d1Q99MB3 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms