Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
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PtprtQ99M80 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
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PtprtQ99M80 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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PtprtQ99M80 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PtprtQ99M80 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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