Protein–RNA interactions for Protein: Q99LM2

Cdk5rap3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap3Q99LM2 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk5rap3Q99LM2 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk5rap3Q99LM2 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdk5rap3Q99LM2 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdk5rap3Q99LM2 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdk5rap3Q99LM2 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdk5rap3Q99LM2 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5rap3Q99LM2 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms