Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rcbtb2Q99LJ7 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rcbtb2Q99LJ7 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rcbtb2Q99LJ7 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rcbtb2Q99LJ7 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rcbtb2Q99LJ7 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms