Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp16Q99LG0 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms