Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RtcbQ99LF4 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RtcbQ99LF4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms