Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE3

Lysmd3, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lysmd3Q99LE3 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Lysmd3Q99LE3 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lysmd3Q99LE3 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lysmd3Q99LE3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Lysmd3Q99LE3 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lysmd3Q99LE3 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lysmd3Q99LE3 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lysmd3Q99LE3 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lysmd3Q99LE3 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Lysmd3Q99LE3 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lysmd3Q99LE3 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lysmd3Q99LE3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lysmd3Q99LE3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lysmd3Q99LE3 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lysmd3Q99LE3 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lysmd3Q99LE3 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lysmd3Q99LE3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lysmd3Q99LE3 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lysmd3Q99LE3 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lysmd3Q99LE3 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lysmd3Q99LE3 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lysmd3Q99LE3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Lysmd3Q99LE3 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lysmd3Q99LE3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lysmd3Q99LE3 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lysmd3Q99LE3 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lysmd3Q99LE3 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lysmd3Q99LE3 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lysmd3Q99LE3 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lysmd3Q99LE3 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lysmd3Q99LE3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lysmd3Q99LE3 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lysmd3Q99LE3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lysmd3Q99LE3 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lysmd3Q99LE3 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lysmd3Q99LE3 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lysmd3Q99LE3 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lysmd3Q99LE3 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Lysmd3Q99LE3 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Lysmd3Q99LE3 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lysmd3Q99LE3 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Lysmd3Q99LE3 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lysmd3Q99LE3 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lysmd3Q99LE3 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lysmd3Q99LE3 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Lysmd3Q99LE3 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lysmd3Q99LE3 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lysmd3Q99LE3 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lysmd3Q99LE3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lysmd3Q99LE3 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lysmd3Q99LE3 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lysmd3Q99LE3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lysmd3Q99LE3 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lysmd3Q99LE3 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lysmd3Q99LE3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lysmd3Q99LE3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms