Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gps1Q99LD4 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms