Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms