Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Apobec3Q99J72 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms