Protein–RNA interactions for Protein: Q99J38

Ttc30a1, Tetratricopeptide repeat protein 30A1, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc30a1Q99J38 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Ttc30a1Q99J38 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc30a1Q99J38 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc30a1Q99J38 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc30a1Q99J38 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc30a1Q99J38 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Ttc30a1Q99J38 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc30a1Q99J38 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc30a1Q99J38 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc30a1Q99J38 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Ttc30a1Q99J38 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc30a1Q99J38 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Ttc30a1Q99J38 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc30a1Q99J38 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc30a1Q99J38 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc30a1Q99J38 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc30a1Q99J38 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc30a1Q99J38 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ttc30a1Q99J38 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc30a1Q99J38 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc30a1Q99J38 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ttc30a1Q99J38 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ttc30a1Q99J38 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ttc30a1Q99J38 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ttc30a1Q99J38 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc30a1Q99J38 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ttc30a1Q99J38 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc30a1Q99J38 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc30a1Q99J38 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Ttc30a1Q99J38 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc30a1Q99J38 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc30a1Q99J38 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc30a1Q99J38 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc30a1Q99J38 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc30a1Q99J38 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc30a1Q99J38 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc30a1Q99J38 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc30a1Q99J38 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc30a1Q99J38 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc30a1Q99J38 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc30a1Q99J38 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc30a1Q99J38 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Ttc30a1Q99J38 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc30a1Q99J38 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc30a1Q99J38 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc30a1Q99J38 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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