Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Smim11aQ99J19 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Smim11aQ99J19 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Smim11aQ99J19 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Smim11aQ99J19 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Smim11aQ99J19 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Smim11aQ99J19 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Smim11aQ99J19 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Smim11aQ99J19 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Smim11aQ99J19 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Smim11aQ99J19 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Smim11aQ99J19 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Smim11aQ99J19 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Smim11aQ99J19 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Smim11aQ99J19 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Smim11aQ99J19 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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Smim11aQ99J19 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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Smim11aQ99J19 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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Smim11aQ99J19 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Smim11aQ99J19 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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