Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Ctu1Q99J10 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctu1Q99J10 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctu1Q99J10 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Ctu1Q99J10 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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