Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf144aQ925F3 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms