Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Trim7Q923T7 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Trim7Q923T7 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Trim7Q923T7 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Trim7Q923T7 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Trim7Q923T7 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim7Q923T7 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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Trim7Q923T7 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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