Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clip1Q922J3 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms