Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Afg3l1Q920A7 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Afg3l1Q920A7 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms