Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde6cQ91ZQ1 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
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Pde6cQ91ZQ1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde6cQ91ZQ1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Pde6cQ91ZQ1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde6cQ91ZQ1 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde6cQ91ZQ1 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde6cQ91ZQ1 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde6cQ91ZQ1 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde6cQ91ZQ1 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde6cQ91ZQ1 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
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