Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK2

Rrp1b, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1bQ91YK2 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rrp1bQ91YK2 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms