Protein–RNA interactions for Protein: Q91WU4

Tmco4, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco4Q91WU4 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmco4Q91WU4 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmco4Q91WU4 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmco4Q91WU4 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmco4Q91WU4 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmco4Q91WU4 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmco4Q91WU4 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmco4Q91WU4 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmco4Q91WU4 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmco4Q91WU4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmco4Q91WU4 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmco4Q91WU4 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmco4Q91WU4 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms